Las autoridades iraníes transmitieron al diplomático europeo su "descontento y su preocupación" por el suceso, según la prensa local.
El incidente ocurrió cuando un pequeño grupo de manifestantes trató de penetrar en el edificio, situado en Lidinge, un archipiélago cercano a la capital sueca.
Efectivos de la policía intervinieron con contundencia y al menos una persona fue arrestada.
Irán es escenario desde hace más de dos semanas de protestas callejeras y enfrentamientos a causa de la polémica reelección del presidente, Mahmud Ahmadineyad, denunciada por la oposición como fraudulenta.